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華南植物園:象腿蕉染色體基因組組裝研究取得新進展

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日期:2022-05-16 14:26:22    來源:中國科學報    

中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊,在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發(fā)表于Gigascience。王梓維為該文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者,華南植物園教授葛學軍和法國農業(yè)科學中心教授Mathieu Rouard參與該項工作。

象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉類植物,原產(chǎn)于中國云南和東南亞地區(qū),具有重要的觀賞、飼用和藥用價值。研究人員采用單分子納米孔、Illumina測序策略,結合染色體構像捕獲技術,發(fā)表了首個象腿蕉染色體級別的基因組序列,長度為481.5 Mbp,完整性較高(BUSCO 98.3%),注釋獲得36,836個編碼基因,重復序列約占基因組的55%。

象腿蕉與芭蕉屬代表物種的比較基因組學研究發(fā)現(xiàn),象腿蕉的長末端重復序列的組成及其插入時間,與芭蕉科其他物種均有差異,芭蕉屬比象腿蕉屬有更多Copia,象腿蕉LTR插入時間(峰值3.5–5 Mya)比芭蕉屬物種(峰值2 Mya)更古老,還發(fā)現(xiàn)芭蕉科在9和11染色體基數(shù)進化過程中復雜多樣的染色體重組事件。該研究結果為蕉類作物保育和改良提供重要的基因組資源。

該研究工作得到了華南植物園海外知名學者項目、國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金的資助。(作者:朱漢斌)

關鍵詞: 華南植物園 象腿蕉染色體基因組 組裝研究 蕉類植物

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